Belägringen av Jerusalem genomfördes från 7 juni till 15 juli 1099 under första korståget (1096-1099).
Efter att ha fångat Antiokien i juni 1098 stannade korsfararna kvar i området och diskuterade deras handlingssätt. Medan vissa nöjde sig med att etablera sig på de redan fångade länderna, började andra genomföra sina egna små kampanjer eller krävde en marsch mot Jerusalem. Den 13 januari 1099, efter att ha avslutat belägringen av Maarat, började Raymond av Toulouse flytta söderut mot Jerusalem med hjälp av Tancred och Robert av Normandie. Denna grupp följdes nästa månad av styrkor under ledning av Godfrey från Bouillon. På väg framför Medelhavskusten mötte korsfararna lite motstånd från lokala ledare.
Dessa ledare som nyligen erövrats av fatimiderna hade begränsad kärlek till sina nya herrar och var villiga att bevilja fri passage genom sina länder såväl som att öppet handla med korsfararna. Vid ankomsten till Arqa belägrade Raymond staden. Sammanlagt av Godfrey's styrkor i mars fortsatte den kombinerade armén belägringen även om spänningarna bland befälhavarna sprang högt. Brott från belägringen den 13 maj flyttade korsfararna söderut. Eftersom fatimiderna fortfarande försökte befästa sitt grepp om regionen, kontaktade de korsfarledarna med erbjudanden om fred i utbyte mot att stoppa deras framsteg.
Dessa avvisades och den kristna armén flyttade genom Beirut och Tyres innan de vände inåt landet på Jaffa. När de når Ramallah den 3 juni fann de byn övergiven. Medveten om korsfararnas avsikter, den Fatimid guvernören i Jerusalem, Iftikhar ad-Daula, började förbereda sig för en belägring. Även om stadens murar fortfarande skadades från Fatimids fångst av staden ett år tidigare, utvisade han Jerusalems kristna och förgiftade flera av områdets brunnar. Medan Tancred skickades för att fånga Betlehem (taget den 6 juni), anlände korsfararnas armé före Jerusalem den 7 juni.
Avsaknad av tillräckligt med män för att investera hela staden, utplacerade korsfararna mitt emot Jerusalems norra och västra murar. Medan Godfrey, Robert av Normandie, och Robert av Flandern täckte väggarna i norr så långt söder som David Tower, tog Raymond ansvar för att attackera från tornet till Sions berg. Även om mat inte var en omedelbar fråga, hade korsfararna problem med att få vatten. Detta i kombination med rapporter om att en hjälpstyrka lämnade Egypten tvingade dem att flytta snabbt. Genom att försöka ett frontalangrepp den 13 juni vredes korsfararna tillbaka av Fatimid-garnisonen.
Fyra dagar senare ökades korsfarhopparna när genoskiska fartyg anlände till Jaffa med förnödenheter. Fartygen demonterades snabbt och virket rusade till Jerusalem för att bygga belägringsutrustning. Detta arbete började under ögonen av den genoska befälhavaren, Guglielmo Embriaco. När förberedelserna fortsatte, gjorde korsfararna en straffprocess runt stadsmuren den 8 juli som kulminerade med predikningar på Olivberget. De följande dagarna slutfördes två beläggningstorn. Ad-Daula, medveten om korsfararnas verksamhet, arbetade för att stärka försvaret mittemot där tornen byggdes.
Korsfararens attackplan uppmanade Godfrey och Raymond att attackera i motsatta ändar av staden. Även om detta fungerade för att dela försvararna var planen troligtvis resultatet av fiendskap mellan de två männen. Den 13 juli började Godfrey's styrkor sin attack mot de norra murarna. På detta sätt fångade de försvararna överraskande genom att flytta beläggningstornet längre öster under natten. De bröt igenom ytterväggen den 14 juli och pressade på och attackerade innerväggen nästa dag. På morgonen den 15 juli började Ramsons män sitt attack från sydväst.
Motsatt på förberedda försvarare kämpade Raymond attack och hans belägringstorn skadades. När striden rasade på hans front hade Godfrey's män lyckats få den inre muren. Då han spridit sig kunde hans trupper öppna en närbelägen port till staden, vilket gjorde att korsfararna kan svärma in i Jerusalem. När ordet om denna framgång nådde Raymonds trupper, fördubblade de sina ansträngningar och kunde bryta mot Fatimid-försvaret. När korsfararna kom in i staden på två punkter började ad-Daulas män fly tillbaka till Citadellet. Eftersom ytterligare motstånd var hopplöst övergav ad-Daula sig när Raymond erbjöd skydd. Korsfarare ropade "Deus volt" eller "Deus lo volt" ("Gud vill det") i firandet.
I kölvattnet av segern inledde korsfararnas styrkor en utbredd massaker av den besegrade garnisonen och stadens muslimska och judiska befolkningar. Detta sanktionerades huvudsakligen som en metod för att "rensa" staden och samtidigt ta bort ett hot mot korsfararnas baksida, eftersom de snart skulle behöva marschera ut mot de egyptiska hjälptropperna. Efter att ha tagit målet med korstågen började ledarna dela bytet. Godfrey av Bouillon utnämndes till försvarare av den heliga graven den 22 juli medan Arnulf från Chocques blev patriarken i Jerusalem den 1 augusti. Fyra dagar senare upptäckte Arnulf en relik för Sanna korset.
Dessa utnämningar skapade en del stridigheter i korsfarlägret när Raymond och Robert av Normandie blev ilska av Godfrey val. Med ord att fienden närmade sig marscherade korsfararnas armé ut den 10 augusti. Möt fatimiderna vid slaget vid Ascalon och vann en avgörande seger den 12 augusti.