En transisomer är en isomer där funktionella grupper förekommer på motsatta sidor av dubbelbindningen. Cis- och trans-isomerer diskuteras vanligen med avseende på organiska föreningar, men de förekommer också i oorganiska koordinationskomplex och diaziner..
Trans-isomerer identifieras genom att lägga till trans- framför molekylens namn. Ordet trans kommer från det latinska ordet som betyder "över" eller "på andra sidan".
Exempel: Transisomeren av dikloreten är skriven som trans-dikloreten.
Den andra typen av isomer kallas en cis-isomer. Vid cis-konformation är de funktionella grupperna båda på samma sida av dubbelbindningen (intill varandra). Två molekyler är isomerer om de innehåller exakt samma antal och typer av atomer, bara ett annat arrangemang eller rotation runt en kemisk bindning. Molekyler är inte isomerer om de har ett annat antal atomer eller olika typer av atomer från varandra.
Trans-isomerer skiljer sig från cis-isomerer i mer än bara utseende. Fysikaliska egenskaper påverkas också av konformation. Exempelvis tenderar transisomerer att ha lägre smältpunkter och kokpunkter än motsvarande cis-isomerer. De tenderar också att vara mindre täta. Trans-isomerer är mindre polära (mer icke-polära) än cis-isomerer eftersom laddningen är balanserad på motsatta sidor av dubbelbindningen. Transalkaner är mindre lösliga i inerta lösningsmedel än cis-alkaner. Trans alkener är mer symmetriska än cis alkener.
Även om du kanske tror att funktionella grupper fritt kan rotera runt en kemisk bindning, så att en molekyl spontant växlar mellan cis- och transkonformationer, är detta inte så enkelt när dubbla bindningar är inblandade. Organiseringen av elektroner i en dubbelbindning hämmar rotation, så en isomer tenderar att stanna i en eller annan konformation. Det är möjligt att ändra konformation kring en dubbelbindning, men detta kräver tillräcklig energi för att bryta bindningen och sedan reformera den.
I acykliska system är det mer troligt att en förening bildar en transisomer än cis-isomeren eftersom den vanligtvis är mer stabil. Detta beror på att ha båda funktionsgrupper på samma sida av en dubbelbindning kan ge steriskt hinder. Det finns undantag från denna "regel", såsom 1,2-difluoroetylen, 1,2-difluorodiazen (FN = NF), andra halogensubstituerade etylener och några syresubstituerade etylener. När cis-konformationen föredras, benämns fenomenet "cis-effekten".
Rotation är mycket mer fri runt en enda bindning. När rotation sker runt en enda bindning är den rätta terminologin syn- (som cis) och anti (som trans), för att ange den mindre permanenta konfigurationen.
Cis- och trans-konfigurationerna betraktas som exempel på geometrisk isomerism eller konfigurationsisomerism. Cis och trans bör inte förväxlas med E/Z isomeri. E / Z är en absolut stereokemisk beskrivning som endast används när man hänvisar till alkener med dubbelbindningar som inte kan rotera eller ringstrukturer.
Friedrich Woehler märkte först isomerer 1827 när han upptäckte silvercyanat och silvermilminat delar samma kemiska sammansättning, men visade olika egenskaper. År 1828 upptäckte Woehler urea och ammoniumcyanat hade också samma sammansättning, men ändå olika egenskaper. Jöns Jacob Berzelius introducerade termen isomeri 1830. Ordet isomer kommer från det grekiska språket och betyder "lika stor del".