Son till James och Anne Ferguson, Patrick Ferguson föddes den 4 juni 1744 i Edinburgh, Skottland. Son till en advokat, Ferguson, träffade många av figurerna i den skotska upplysningen under sin ungdom som David Hume, John Home och Adam Ferguson. 1759, när det sju åriga kriget rasade, uppmuntras Ferguson att bedriva en militär karriär av sin farbror, brigadegeneral James Murray. En välkänd officer, Murray tjänade under generalmajor James Wolfe i slaget vid Quebec senare samma år. På sin farbrors råd köpte Ferguson en kornetprovision i Royal North British Dragoons (Scots Grays).
Istället för att omedelbart gå med i hans regiment tillbringade Ferguson två år på studier vid Royal Military Academy i Woolwich. 1761 reste han till Tyskland för aktiv tjänst med regementet. Strax efter ankomsten blev Ferguson sjuk av en sjukdom i benet. Sängliggande i flera månader kunde han inte gå med igen i Grays förrän augusti 1763. Även om han var i stånd till aktiv tjänst plågades han av artrit i benet resten av livet. När kriget hade avslutats såg han garnisonplikt runt Storbritannien under de kommande åren. 1768 köpte Ferguson ett kaptenskap i det 70. fotregimentet.
Segeln för Västindien tjänade regimentet i garnisontjänst och hjälpte senare till att sätta ner en slavupprörelse mot Tobago. Medan han var där köpte han en sockerplantage i Castara. Ferguson, som drabbades av feber och problem med benet, återvände till Storbritannien 1772. Två år senare deltog han i ett lätt infanteriträningsläger på Salisbury övervakat av generalmajor William Howe. Ferguson, en skicklig ledare, imponerade snabbt Howe med sin förmåga i fältet. Under denna period arbetade han också med att utveckla en effektiv muskel med lastavlor.
Från och med tidigare verk av Isaac de la Chaumette skapade Ferguson en förbättrad design som han visade den 1 juni. Konstruktionen imponerade den 2 december och imponerade den 2 december och kunde skjuta sex till tio omgångar per minut. Även om överlägsen den brittiska arméns standard Brown Bess-munfyllningsmuskett på vissa sätt var Ferguson-designen betydligt dyrare och tog mycket mer tid att producera. Trots dessa begränsningar producerades cirka 100 och Ferguson fick befäl för ett Experimental Rifle Company i mars 1777 för tjänst i den amerikanska revolutionen.
Ankomsten 1777 gick Fergusons specialutrustade enhet till Howes armé och deltog i kampanjen för att fånga Philadelphia. Den 11 september deltog Ferguson och hans män i slaget vid Brandywine. Under striderna valde Ferguson att inte skjuta på en högt rankad amerikansk officer av heder. Rapporter angav senare att det kan ha varit antingen grev Casimir Pulaski eller general George Washington. När striderna fortsatte, drabbades Ferguson av en musketboll som sprängde hans högra armbåge. Med fallet i Philadelphia fördes han till staden för att återhämta sig.
Under de kommande åtta månaderna tålade Ferguson en serie operationer i hopp om att rädda armen. Dessa visade sig vara ganska framgångsrika, men han återfick aldrig full användning av lemmen. Under sin återhämtning upplöstes Fergusons gevärföretag. Återvända till aktiv tjänst 1778 tjänade han under generalmajor Sir Henry Clinton i slaget vid Monmouth. I oktober skickade Clinton Ferguson till Little Egg Harbor River i södra New Jersey för att eliminera ett bo av amerikanska privatpersoner. Angrep den 8 oktober brände han flera fartyg och byggnader innan han drog sig tillbaka.
Flera dagar senare fick Ferguson veta att Pulaski läger i området och att den amerikanska positionen var lätt bevakad. Angrep den 16 oktober dödade hans trupper cirka femtio män innan Pulaski anlände med hjälp. På grund av de amerikanska förlusterna blev förlovningen känd som Little Egg Harbor Massacre. Opererade från New York i början av 1779, Ferguson utförde spejderuppdrag för Clinton. I kölvattnet av den amerikanska attacken mot Stony Point ledde Clinton honom att övervaka försvaret i området. I december tog Ferguson kommando över American Volunteers, en styrka av New York och New Jersey Loyalists.
I början av 1780 seglade Fergusons kommando som en del av Clintons armé som försökte fånga Charleston, SC. Landning i februari bajoneterades Ferguson av misstag i vänsterarmen när oberstlöjtnant Banastre Tarletons brittiska legion felaktigt attackerade hans läger. När belägringen av Charleston fortsatte arbetade Fergusons män för att avskärma de amerikanska försörjningsvägarna till staden. Tillsammans med Tarleton hjälpte Ferguson att besegra en amerikansk styrka på Monck's Corner den 14 april. Fyra dagar senare höjde Clinton honom till major och backdated promoteringen till föregående oktober.
Flyttar till den norra stranden av Cooper River, Ferguson deltog i fångsten av Fort Moultrie i början av maj. Med Charlestons fall den 12 maj utsåg Clinton Ferguson till milisinspektör för regionen och anklagade honom för att höja enheter av loyalister. När han återvände till New York lämnade Clinton generaldirektör Lord Charles Cornwallis under ledning. I sin roll som inspektör lyckades han ta upp cirka 4 000 män. Efter skirmishing med lokala miliser beordrades Ferguson att ta 1 000 män västerut och skydda Cornwallis 'flank när armén avancerade till North Carolina.
Ferguson etablerade sig i Gilbert Town, NC den 7 september, och flyttade söder tre dagar senare för att fånga upp en milisstyrka under ledning av överste Elijah Clarke. Innan han lämnade skickade han ett meddelande till de amerikanska miliserna på andra sidan Appalachianbergen och beordrade dem att upphöra med sina attacker eller så skulle han korsa bergen och "slösa bort sitt land med eld och svärd." Rädd av Fergusons hot mobiliserades dessa miliser och den 26 september började de röra sig mot den brittiska befälhavaren. När han lärde sig detta nya hot började Ferguson dra sig tillbaka söderut och österut med målet att återförenas med Cornwallis.
I början av oktober konstaterade Ferguson att bergsmilitserna fick sina män. Den 6 oktober bestämde han sig för att ta ställning och tog ställning på King Mountain. Befästning av de högsta delarna av berget, och hans kommando attackerades sent nästa dag. Under slaget vid Kings Mountain omgav amerikanerna berget och överväldigade så småningom Fergusons män. Under striderna sköts Ferguson från sin häst. När han föll fångades hans fot i sadeln och han drogs in i de amerikanska linjerna. Döende, den segrande milisen strippade och urinerade på hans kropp innan den begravdes i en grund grav. På 1920-talet uppfördes en markör över Fergusons grav som nu ligger i Kings Mountain National Military Park.