Tusen dagars krig var ett inbördeskrig som utkämpades i Colombia mellan åren 1899 och 1902. Den grundläggande konflikten bakom kriget var konflikten mellan liberaler och konservativa, så det var ett ideologiskt krig i motsats till ett regionalt, och det delade familjer och kämpades över hela nationen. Efter att cirka 100 000 colombianer hade dött, ställde båda sidor till striderna.
År 1899 hade Colombia en lång tradition av konflikt mellan liberaler och konservativa. De grundläggande frågorna var dessa: de konservativa gynnade en stark centralregering, begränsad rösträtt och starka band mellan kyrka och stat. Liberalerna å andra sidan gynnade starkare regionala regeringar, universella rösträtt och en uppdelning mellan kyrka och stat. De två fraktionerna hade varit i otillbörlighet sedan upplösningen av Gran Colombia 1831.
1898 valdes konservativa Manuel Antonio Sanclemente till president för Colombia. Liberalerna var upprörda eftersom de trodde att betydande valbedrägeri hade ägt rum. Sanclemente, som var långt in i åttiotalet, hade deltagit i en konservativ störtning av regeringen 1861 och var extremt upopulär bland liberalerna. På grund av hälsoproblem var Sanclementes grepp om makten inte särskilt fast och liberala generaler planerade ett uppror för oktober 1899.
Den liberala revolten började i Santander-provinsen. Den första kollisionen ägde rum när liberala styrkor försökte ta Bucaramanga i november 1899 men avvisades. En månad senare fick liberalerna sin största seger av kriget när general Rafael Uribe Uribe ledde en större konservativ styrka vid slaget vid Peralonso. Segern på Peralonso gav liberalerna hopp och styrka att dra ut konflikten i ytterligare två år mot överlägsen antal.
Genom att vägras vägra att pressa sin fördel stannade den liberala generalen Vargas Santos tillräckligt länge för att de konservativa skulle återhämta sig och skicka en armé efter honom. De kolliderade i maj 1900 i Palonegro, i Santander Department. Striden var brutal. Det varade i ungefär två veckor, vilket innebar att nedbrytande kroppar i slutändan blev en faktor på båda sidor. Förtryckande hetta och brist på medicinsk vård gjorde stridsområdet till ett levande helvete när de två arméerna kämpade gång på gång över samma del av diken. När röken rensade fanns det nära 4 000 döda och den liberala armén hade brutit.
Fram till denna tidpunkt hade liberalerna fått hjälp från grannens Venezuela. Venezuelas president Cipriano Castros regering hade sänt män och vapen för att kämpa på den liberala sidan. Den förödande förlusten i Palonegro fick honom att stoppa allt stöd under en tid, även om ett besök från den liberala general Rafael Uribe Uribe övertygade honom att återuppta sändningshjälpen.
Efter farten vid Palonegro var liberalernas nederlag bara en tidsfråga. Deras arméer i tatcher, de skulle lita på resten av kriget mot geriljataktik. De lyckades säkra vissa segrar i dagens Panama, inklusive en småskalig marinstrid som såg pistolbåten Padilla sjunka det chilenska fartyget ("lånat" av de konservativa) Lautaro i hamnen i Panama City. Trots dessa små segrar, även förstärkningar från Venezuela, kunde inte rädda den liberala saken. Efter slaktet i Peralonso och Palonegro hade folket i Colombia tappat någon önskan att fortsätta striderna.
Moderate liberaler hade försökt få ett fredligt slut på kriget under en tid. Även om deras sak förlorades vägrade de att betrakta en ovillkorlig överlämnande: de ville ha en liberal representation i regeringen som ett minimipris för att avbryta fientligheterna. De konservativa visste hur svag den liberala ställningen var och förblev fast i sina krav. Neerlandia-fördraget, undertecknat den 24 oktober 1902, var i grunden ett eldupphörsavtal som inkluderade avväpnandet av alla liberala styrkor. Kriget avslutades formellt den 21 november 1902, då ett andra fördrag undertecknades på däck av det amerikanska krigsfartyget Wisconsin.
Tusen dagars krig gjorde ingenting för att lindra de långvariga skillnaderna mellan liberalerna och konservativa, som återigen skulle gå i krig på 1940-talet i konflikten känd som La Violencia. Även om det nominellt var en konservativ seger fanns det inga riktiga vinnare, bara förlorare. De förlorare var folket i Colombia, eftersom tusentals liv förlorades och landet blev härjat. Som en extra förolämpning tillät kaoset som orsakats av kriget Förenta staterna att åstadkomma Panama oberoende, och Colombia förlorade detta värdefulla territorium för alltid.
Tusen dagars krig är välkänt i Colombia som en viktig historisk händelse, men det har uppmärksammats internationellt på grund av en extraordinär roman. Nobelprisvinnaren Gabriel García Márquez 'mästerverk från 1967 Hundra år av ensamhet täcker ett sekel i en fiktiv colombiansk familj. En av de mest berömda karaktärerna i denna roman är överste Aureliano Buendía, som lämnar den lilla staden Macondo för att slåss i flera år i tusendagskriget (för rekordet kämpade han för liberalerna och tros ha varit löst baserat på Rafael Uribe Uribe).