The Three Domain System, utvecklat av Carl Woese 1990, är ett system för klassificering av biologiska organismer.
Innan Woese upptäckte archaea som skilde sig från bakterier 1977 trodde forskare att det bara fanns två typer av liv: eukarya och bakterier.
Den högsta rankingen som tidigare använts hade varit "kungariket", baserat på det fem kungarikssystemet som antogs i slutet av 1960-talet. Denna klassificeringssystemmodell är baserad på principer utvecklade av den svenska forskaren Carolus Linné, vars hierarkiska system grupperar organismer baserade på gemensamma fysiska egenskaper.
När forskare lär sig mer om organismer förändras klassificeringssystem. Genetisk sekvensering har gett forskare ett helt nytt sätt att analysera förhållanden mellan organismer.
Det nuvarande Three Domain System grupperar organismer primärt baserat på skillnader i ribosomal RNA (rRNA) struktur. Ribosomal RNA är en molekylär byggsten för ribosomer.
Enligt detta system klassificeras organismer i tre domäner och sex riken. Domänerna är
Riken är
Den här Archaea-domänen innehåller encelliga organismer. Archaea har gener som liknar både bakterier och eukaryoter. Eftersom de är väldigt lik bakterier i utseende, misstog de ursprungligen bakterier.
Liksom bakterier är archaea prokaryotiska organismer och har inte en membranbunden kärna. De saknar också inre cellorganeller och många har ungefär samma storlek som och liknar sin form som bakterier. Archaea reproduceras med binär klyvning, har en cirkulär kromosom och använder flagella för att röra sig i sin miljö liksom bakterier..
Archaea skiljer sig från bakterier i cellväggssammansättning och skiljer sig från både bakterier och eukaryoter i membrankomposition och rRNA-typ. Dessa skillnader är tillräckligt stora för att garantera att archaea har en separat domän.
Archaea är extrema organismer som lever under några av de mest extrema miljöförhållandena. Detta inkluderar inom hydrotermiska ventiler, sura fjädrar och under arktisk is. Archaea är uppdelat i tre huvudphila: Crenarchaeota, Euryarchaeota, och Korarchaeota.
Bakterier klassificeras under bakteriedomänen. Dessa organismer fruktas i allmänhet eftersom vissa är patogena och kan orsaka sjukdom.