Aminosyror

Aminosyror är en typ av organisk syra som innehåller både en karboxylgrupp (COOH) och en aminogrupp (NH)₂). Den allmänna formeln för en aminosyra anges nedan. Även om den neutralt laddade strukturen ofta skrivs är den felaktig eftersom den sura COOH och basiska NH₂ grupper reagerar med varandra för att bilda ett inre salt som kallas en zwitterion. Zwitterion har ingen nettoladdning; det finns en negativ (COO^-) och en positiv (NH₃⁺) laddning.

Det finns 20 aminosyror härrörande från proteiner. Det finns flera metoder för att kategorisera dem, men en av de vanligaste är att gruppera dem efter deras sidokedjor.

Icke-polära sidokedjor

Det finns åtta aminosyror med icke-polära sidokedjor. Glycin, alanin och prolin har små, icke-polära sidokedjor och är alla svagt hydrofoba. Fenylalanin, valin, leucin, isoleucin och metionin har större sidokedjor och är starkare hydrofoba.

Polära, oladdade sidokedjor

Det finns också åtta aminosyror med polära, oladdade sidokedjor. Serin och treonin har hydroxylgrupper. Asparagin och glutamin har amidgrupper. Histidin och tryptofan har heterocykliska aromatiska aminsidokedjor. Cystein har en sulfhydrylgrupp. Tyrosin har en fenolisk sidokedja. Sulfhydrylgruppen av cystein, fenolisk hydroxylgrupp av tyrosin och imidazolgrupp av histidin visar alla en viss grad av pH-beroende jonisering.

Laddade sidkedjor

Det finns fyra aminosyror med laddade sidokedjor. Asparaginsyra och glutaminsyra har karboxylgrupper på sina sidokedjor. Varje syra joniseras helt vid pH 7,4. Arginin och lysin har sidokedjor med aminogrupper. Deras sidokedjor är helt protonerade vid pH 7,4.